【技術實現步驟摘要】
本專利技術屬于生物，尤其涉及一種與凡納濱對蝦生長性狀相關的snp分子標記及其應用。
技術介紹
1、凡納濱對蝦是目前世界上養殖產量最高的蝦類。原產于南美太平洋沿岸水域，在厄瓜多爾沿岸的分布最為集中，其肉質鮮美、營養豐富，是集約化養殖的優良品種。生長性狀是對蝦最重要的經濟性狀之一。對蝦生長速度的快慢直接影響著養殖業的經濟效益。養殖生長速度快的對蝦品種有利于池塘利用率、降低病害風險和養殖成本、提高產量。
2、近年來不少學者對凡納濱對蝦的生物學特性和養殖技術進行了研究，但是與其他物種尤其是農作物相比，凡納濱對蝦生產性能提高的選育研究相對緩慢。那是因為傳統的選育方式存在成本高、工作量大、周期長、效率低、后代性狀分離等問題。解決問題的有效方法是在傳統選育基礎上，使用分子標記輔助育種。分子標記輔助育種可以提高選擇的準確性、在早期鑒定具有優良性狀的個體，篩選優良親本，從而加快育種進程，縮短育種周期。
3、zbtb24(zinc?finger-andbtb?domain-containingprotein?24)隸屬于鋅指蛋白家族。目前針對zbtb24基因相關功能的研究主要在人上，而對于凡納濱對蝦的相關研究較少。研究表明zbtb24基因參與骨形態發生蛋白2(bmp2)誘導的轉錄，其突變可能導致免疫缺陷、著絲粒不穩定和面部異常(icf2)綜合征。icf2綜合征的特征之一是生長遲緩，這表明zbtb24可能是一個與生長有關的基因。本研究結果將為此提供相關資料參考。
技術實現思路
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2、所述snp1位于seq?id?no.1所示的核苷酸序列的295bp位點處，該位點的堿基為g或a；所述snp1的gg基因型為優勢基因型；
3、所述snp2位于seq?id?no.1所示的核苷酸序列的493bp位點處，該位點的堿基為t或c；所述snp2的tt基因型為優勢基因型；
4、所述snp3位于seq?id?no.1所示的核苷酸序列的595bp位點處，該位點的堿基為a或g；所述snp3的aa基因型為優勢基因型。
5、本專利技術還提供了一種檢測上述snp分子標記的試劑在凡納濱對蝦生長性狀相關選擇育種中的應用。
6、優選地，所述應用是以待測凡納濱對蝦的基因組dna為模板，通過pcr擴增、測序，確定所述的snp分子標記的基因型，當snp1的基因型為gg時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當snp2的基因型為tt時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當snp3的基因型為aa時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當snp1、snp2和snp3的單倍型組合基因型為ggttaa時，選擇該個體作為后備親本進行育種。
7、更優選地，所述pcr擴增時使用的pcr引物序列如seq?id?no.2-3所示。
8、更優選地，所述pcr擴增體系如下：ddh2o?13.4μl；10×buffer?2μl；2.5mm的dntp1.6μl；10mm的上游引物0.4μl；10mm的下游引物0.4μl；taq酶0.2μl；30ng/μl的dna模板2μl。
9、更優選地，所述pcr擴增條件如下：
10、a.94℃預變性10min；
11、b.35個循環的鏈式反應，包括：94℃變性1min，58℃退火1min，72℃延伸1min；
12、c.72℃終延伸10min。
13、本專利技術還提供了一種評價凡納濱對蝦生長性狀的方法，通過檢測獲得待測凡納濱對蝦snp1-snp3的基因型，再通過基因型評估其生長性能；
14、所述snp1位于seq?id?no.1所示的核苷酸序列的295bp位點處，該位點的堿基為g或a；所述snp1的gg基因型為優勢基因型；
15、所述snp2位于seq?id?no.1所示的核苷酸序列的493bp位點處，該位點的堿基為t或c；所述snp2的tt基因型為優勢基因型；
16、所述snp3位于seq?id?no.1所示的核苷酸序列的595bp位點處，該位點的堿基為a或g；所述snp3的aa基因型為優勢基因型。
17、本專利技術還提供了一種用于評價凡納濱對蝦生長性能的產品，所述產品中含有可擴增核苷酸序列如seq?id?no.1所示的引物。
18、優選地，所述引物的核苷酸序列如seq?id?no.2-3所示。
19、更優選地，所述產品為試劑盒。
20、與現有技術相比，本專利技術具有如下有益效果：
21、本專利技術以凡納濱對蝦為對象，提供了若干評價凡納濱對蝦生長性狀的分子標記及相關分子標記在凡納濱對蝦育種中的使用方法，其可應用于具有優良生長性狀凡納濱對蝦新品種的早期選育，降低選育成本、減少選育周期提高效率，為凡納濱對蝦的品種改良提供理論基礎。
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1.一種與凡納濱對蝦生長性狀相關的SNP分子標記，其特征在于，所述SNP分子標記為SNP1、SNP2、SNP3中的至少一種；
2.一種檢測權利要求1所述的SNP分子標記的試劑在凡納濱對蝦生長性狀相關選擇育種中的應用。
3.根據權利要求2所述的應用，其特征在于，以待測凡納濱對蝦的基因組DNA為模板，通過PCR擴增、測序，確定所述的SNP分子標記的基因型，當SNP1的基因型為GG時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當SNP2的基因型為TT時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當SNP3的基因型為AA時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當SNP1、SNP2和SNP3的單倍型組合基因型為GG?TTAA時，選擇該個體作為后備親本進行育種。
4.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述PCR擴增時使用的PCR引物序列如SEQID?NO.2-3所示。
5.根據權利要求4所述的應用，其特征在于，所述PCR擴增體系如下：ddH2O?13.4μL；10×Buffer?2μL；2.5mM的dNTP?1.6μL；10mM的上游引物0.4μL；10mM的下游
6.根據權利要求5所述的應用，其特征在于，所述PCR擴增條件如下：
7.一種評價凡納濱對蝦生長性狀的方法，其特征在于，通過檢測獲得待測凡納濱對蝦SNP1-SNP3的基因型，再通過基因型評估其生長性能；
8.一種用于評價凡納濱對蝦生長性能的產品，其特征在于，所述產品中含有可擴增核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示的引物。
9.根據權利要求8所述的產品，其特征在于，所述引物的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.2-3所示。
10.根據權利要求8或9所述的產品，其特征在于，所述產品為試劑盒。
...【技術特征摘要】
1.一種與凡納濱對蝦生長性狀相關的snp分子標記，其特征在于，所述snp分子標記為snp1、snp2、snp3中的至少一種；
2.一種檢測權利要求1所述的snp分子標記的試劑在凡納濱對蝦生長性狀相關選擇育種中的應用。
3.根據權利要求2所述的應用，其特征在于，以待測凡納濱對蝦的基因組dna為模板，通過pcr擴增、測序，確定所述的snp分子標記的基因型，當snp1的基因型為gg時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當snp2的基因型為tt時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當snp3的基因型為aa時，選擇該個體作為后備親本進行育種；當snp1、snp2和snp3的單倍型組合基因型為gg?ttaa時，選擇該個體作為后備親本進行育種。
4.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述pcr擴增時使用的pcr引物序列如seqid?no.2-3所示。
5.根據權利...
【專利技術屬性】
技術研發人員：司永國，李丹陽，張永亮，韋浩，
申請(專利權)人：清遠金灃生物藥品有限公司，
類型：發明
國別省市：
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