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【技術實現步驟摘要】
本申請涉及生物檢測,具體而言,涉及一種檢測結核分枝桿菌的slamp引物組和試劑盒。
技術介紹
1、結核分枝桿菌(mycobacteriumtuberculosis,mtb)是引起結核病的病原體,該菌可侵犯全身各器官,但以引起肺結核最多見。結核病是一種古老的疾病,全球廣泛分布,是細菌感染性疾病致死的首位原因。
2、結核分枝桿菌的經典檢測方法為分離培養,具體為將經中和集菌材料接種于固體培養基,器皿口加橡皮塞于37℃培養,每周觀察1次。但結核分枝桿菌生長緩慢,一般需2~4周長成肉眼可見的落菌。其他較為快速和準確的方法,包括基于rt-pcr的針對結核分枝桿菌dna的擴增信號的檢測,每毫升中只需含幾個細菌即可檢測到陽性,且1~2天即得出結果。
3、現有的檢測方法中的,pcr、dna探針技術等。盡管這些技術能快速檢測樣品中結核分枝桿菌的數量,但這些方法依賴于特殊而昂貴的設備,且其操作過程復雜費時(包括dna的分離、雜交、比色以及探針和引物的合成等),只有熟練掌握了其操作技巧的技術人員才能完成測試。因此,以上方法并不適用于現場快速檢測,建立一種快速、靈敏、特異的結核分枝桿菌檢測方法迫在眉睫。
技術實現思路
1、本申請的目的在于提供一種檢測結核分枝桿菌的slamp引物組,此slamp引物組具有敏感性高、特異性強的優點。
2、本申請的另一目的在于提供一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,該試劑盒檢測速度快、準確性高、使用方便。
3、為解決上述技術問題,本申請采
4、一方面,本申請提供一種檢測結核分枝桿菌的slamp引物組,所述slamp引物組為引物對mtb-sf/r-sr;
5、其中,mtb-sf的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,mtb-sr的核苷酸序列如seq?idno.2所示。
6、另一方面,本申請提供一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,所述試劑盒的反應體系包括上述slamp引物組。
7、基于短鏈頸環介導的核酸恒溫擴增技術(short?loop?mediated?isothermalamplification?ofnucleic?acids,slamp)是專利技術人團隊在前期開發的cda技術(中國專利授權號:zl202110473121.8)和日本lamp核酸擴增的方法的基礎上,新近改進研發的一種核酸在恒溫條件下的擴增技術(中國專利申請號:202411655233.5)。
8、團隊前期所研發的slamp方法(中國專利申請號:202411655233.5)主要利用2個不同的特異性引物識別靶基因的特定區域,在恒溫條件進行擴增反應。與常規基因檢測手段(如pcr等)相比,slamp反應在恒溫水浴箱中便可完成,儀器設備要求低,較傳統pcr和培養法操作簡單許多,不需要專業人士也可準確完成,且擴增結果可結合金屬離子指示劑羥基萘酚蘭(hnb),通過肉眼觀察顏色變化以實現對結果的判斷,使其適用于基層醫療機構及地方檢驗檢疫部門。并且,slamp還可以大大縮短操作時間,減少樣品污染機會,適合應用于結核分枝桿菌的快速診斷。此外,slamp所用關鍵成環引物約為30bp,較lamp中成環引物40bp短,相關引物設計極為簡單,僅需做簡單重排,這將極大程度的節約設計時間和開發成本。
9、相對于現有技術,本申請的實施例至少具有如下優點或有益效果:
10、1、本申請通過對結核分枝桿菌的特異保守區域(genbank:cp136197.1)設計多個引物組,并從中篩選出擴增效率最高的引物組。該引物組由2條引物組成,包括序列內引物對(mtb-sf/mtb-sr)分別為上下游外部引物。本申請提供的引物組敏感性高、特異性強,由其制成的試劑盒能夠快速、準確的檢測到待測樣品中含有的結核分枝桿菌。
11、2、由于本申請提供的引物組具有極高的特異性,slamp擴增所需時間短,進一步縮短檢測的時間,簡化操作。
12、3、本申請提供的方法或試劑盒無需昂貴的儀器、也無需復雜的操作就可完成對結核分枝桿菌的快速準確檢測,因此,適用于專業程度不高的機場、海關、口岸、社區等地的現場快速檢測。本申請所提供的可視化試劑盒將為現場檢測提供極大便利,可實現對結核分枝桿菌快速準確的檢測。
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1.一種檢測結核分枝桿菌的SLAMP引物組,其特征在于,所述SLAMP引物組為引物對MTB-SF/R-SR;
2.一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒的反應體系包括權利要求1所述的SLAMP引物組。
3.根據權利要求2所述的一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述SLAMP引物組中,引物MTB-SF與引物MTB-SR的濃度均為1~2μM。
4.根據權利要求2所述的一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒的反應體系還包括Bst聚合酶、SLAMP反應緩沖液、反應溶劑以及顯色劑。
5.根據權利要求4所述的一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述顯色劑選自SYBR?green?I、Eva?green、羥基萘酚藍以及鉻黑T中的一種。
6.根據權利要求4所述的一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述SLAMP反應緩沖液包括:Tris-HCl、KCl、(NH4)2SO4、MgSO4和TritonX-100。
7.根據權利要求2所述的一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述
...【技術特征摘要】
1.一種檢測結核分枝桿菌的slamp引物組,其特征在于,所述slamp引物組為引物對mtb-sf/r-sr;
2.一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒的反應體系包括權利要求1所述的slamp引物組。
3.根據權利要求2所述的一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述slamp引物組中,引物mtb-sf與引物mtb-sr的濃度均為1~2μm。
4.根據權利要求2所述的一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒的反應體系還包括bst聚合酶、slamp反應緩沖液、反應溶劑以及顯色劑。
5.根據權利要求4所述的一種檢測結核分枝桿菌的試劑盒,其特征在于,所述顯色劑選自sybr?green?i、eva?green...
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