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    用于多參數膀胱癌細胞精準分子分型的核酸適體及其應用制造技術

    技術編號:44508278 閱讀:3 留言:0更新日期:2025-03-07 13:05
    本申請公開了用于多參數膀胱癌細胞精準分子分型的核酸適體及其應用,屬于生物技術領域。本申請要解決的技術問題是:如何實現臨床中膀胱癌的早期精準診斷以及膀胱癌的分子分型。為解決該技術問題,本申請包括核酸適體Seq12a、BCfsw1?3a、BCfsw1?4a、BCfsw1?10a、BCfsw2?19a、BCfsw2?19a在內的核酸適體及其組成的組合物。本申請針對膀胱癌不同級別細胞篩選以及膀胱癌臨床尿液樣本進行核酸適體的篩選,得到了涵蓋不同類型膀胱癌信息的核酸適體組,在膀胱癌細胞及正常細胞系上實現了細胞分子分型,并將其初步應用于臨床尿液樣本分子分型上以及進行膀胱癌復發病程監控。

    【技術實現步驟摘要】

    本申請涉及生物,具體涉及用于多參數膀胱癌細胞精準分子分型的核酸適體及其應用


    技術介紹

    1、膀胱癌是泌尿系統最常見的惡性腫瘤之一,在男性中比女性更為常見。膀胱癌易復發、侵襲及轉移,新診斷的膀胱癌患者中約5%的患者已發生遠處轉移。盡管大多數低級別的腫瘤進展概率低,生存率高,但是在手術治療后經常出現短期復發。膀胱癌嚴重威脅人類健康,但其診斷和治療水平幾乎停滯不前。隨著分子生物學的發展,提出了不少膀胱癌分子分型方案,對膀胱癌分子分型有助于預測患者對藥物的反應性、判斷患者預后。但相較于其他癌癥,膀胱癌的分子分型尚處于起步階段,還需要統一、成熟、可行性強的分子分型方案以指導膀胱癌的診治。

    2、核酸適體是具有特定三維構象的單鏈dna或rna片段,可以識別從小分子到腫瘤細胞在內的多種靶標類型,被廣泛用于各種疾病生物標志物的發現和識別,同時也為膀胱癌的精準診療提供了新的思路和方法。核酸適體被稱為“科學家的抗體”,核酸適體相較于抗體具有免疫原性低、易于修飾等優勢。核酸適體是由各種selex方法篩選得到的。根據selex對象的不同,傳統的篩選方法可以分為:小分子篩選、細胞篩選、蛋白篩選、組織篩選、活體篩選等。本申請主要利用細胞篩選(cell-selex)技術篩選得到特異性dna核酸適體。cell-selex是以整個細胞作為靶標篩選特異性dna適體的技術,可以識別膜蛋白天然構象、實現多靶點核酸適體的篩選。目前利用核酸適體對多種癌癥進行了分子分型研究,包括對不同白血病亞型的分子識別、6種癌癥外泌體的分子分型等等。還未有核酸適體在膀胱癌中的分子分型研究,多參數核酸適體組對膀胱癌進行分子分型具有廣闊的應用前景。針對膀胱癌這個高發病率的腫瘤,也已報導了一些核酸適體,如特異性結合en2的核酸適體eba、特異性結合ckap4的核酸適體spl3c、特異性結合ncl的核酸適體tb-5等等。但由于膀胱癌具有高度異質性,這些針對單一標志物的核酸適體暫時無法滿足膀胱癌的精準診斷。另外,細胞系篩選的核酸適體往往難以反映臨床樣本的真實情況,有時在細胞篩選獲得的核酸適體難以在臨床樣本結合。

    3、因此針對不同的臨床樣本篩選獲得包含更多臨床樣本信息的核酸適體探針組合對臨床樣本的檢測及標志物的發現具有十分重要的意義。


    技術實現思路

    1、本申請要解決的技術問題是:如何實現臨床中膀胱癌的早期精準診斷以及膀胱癌的分子分型。為解決該技術問題,本申請提供以下技術方案:

    2、本申請提供核酸適體組合物,所述核酸適體組合物至少包括核酸適體seq12a,所述核酸適體seq12a為核苷酸序列是seq?id?no.21的單鏈dna分子。

    3、進一步地,所述核酸適體為組合物,所述核酸適體組合物還包括如下六個核酸適體中的全部或部分:

    4、(a3)核酸適體bcfsw1-3a:核苷酸序列是seq?id?no.3的單鏈dna分子;

    5、(a4)核酸適體bcfsw1-4a:核苷酸序列是seq?id?no.4的單鏈dna分子;

    6、(a10)核酸適體bcfsw1-10a:核苷酸序列是seq?id?no.10的單鏈dna分子;

    7、(a17)核酸適體bcfsw2-19a:核苷酸序列是seq?id?no.17的單鏈dna分子;

    8、(a18)核酸適體bcfsw2-23a:核苷酸序列是seq?id?no.18的單鏈dna分子;

    9、(a1)核酸適體bcfsw1-1a:核苷酸序列是seq?id?no.1的單鏈dna分子;

    10、所述部分為1個或1個以上核酸適體。

    11、進一步地,所述的核酸適體組合物還包括如下十四個核酸適體中的全部或部分:

    12、(a2)核酸適體bcfsw1-2a:核苷酸序列是seq?id?no.2的單鏈dna分子;

    13、(a5)核酸適體bcfsw1-5a:核苷酸序列是seq?id?no.5的單鏈dna分子;

    14、(a6)核酸適體bcfsw1-6a:核苷酸序列是seq?id?no.6的單鏈dna分子;

    15、(a7)核酸適體bcfsw1-7a:核苷酸序列是seq?id?no.7的單鏈dna分子;

    16、(a8)核酸適體bcfsw1-8a:核苷酸序列是seq?id?no.8的單鏈dna分子;

    17、(a9)核酸適體bcfsw1-9a:核苷酸序列是seq?id?no.9的單鏈dna分子;

    18、(a11)核酸適體bcfsw2-5a:核苷酸序列是seq?id?no.11的單鏈dna分子;

    19、(a12)核酸適體bcfsw2-6a:核苷酸序列是seq?id?no.12的單鏈dna分子;

    20、(a13)核酸適體bcfsw2-10a:核苷酸序列是seq?id?no.13的單鏈dna分子;

    21、(a14)核酸適體bcfsw2-14a:核苷酸序列是seq?id?no.14的單鏈dna分子;

    22、(a15)核酸適體bcfsw2-16a:核苷酸序列是seq?id?no.15的單鏈dna分子;

    23、(a16)核酸適體bcfsw2-17a:核苷酸序列是seq?id?no.16的單鏈dna分子;

    24、(a19)核酸適體bcfsw2-34a:核苷酸序列是seq?id?no.19的單鏈dna分子;

    25、(a20)核酸適體bcfsw2-35a:核苷酸序列是seq?id?no.20的單鏈dna分子;

    26、所述部分為1個或1個以上核酸適體。

    27、本申請還提供如下二十一個中的任意一個核酸適體:

    28、(a21)核酸適體seq12a:核苷酸序列是seq?id?no.21的單鏈dna分子;

    29、(a3)核酸適體bcfsw1-3a:核苷酸序列是seq?id?no.3的單鏈dna分子;

    30、(a4)核酸適體bcfsw1-4a:核苷酸序列是seq?id?no.4的單鏈dna分子;

    31、(a10)核酸適體bcfsw1-10a:核苷酸序列是seq?id?no.10的單鏈dna分子;

    32、(a17)核酸適體bcfsw2-19a:核苷酸序列是seq?id?no.17的單鏈dna分子;

    33、(a18)核酸適體bcfsw2-23a:核苷酸序列是seq?id?no.18的單鏈dna分子;

    34、(a1)核酸適體bcfsw1-1a:核苷酸序列是seq?id?no.1的單鏈dna分子;

    35、(a2)核酸適體bcfsw1-2a:核苷酸序列是seq?id?no.2的單鏈dna分子;

    36、(a5)核酸適體bcfsw1-5a:核苷酸序列是seq?id?no.5的單鏈dna分子;

    37、(a6)核酸適體bcfsw1-6a:核苷酸序列是seq?id?no.6的單鏈dna分子;

    <本文檔來自技高網...

    【技術保護點】

    1.核酸適體組合物,其特征在于,所述核酸適體組合物至少包括核酸適體Seq12a,所述核酸適體Seq12a為核苷酸序列是SEQ?ID?NO.21的單鏈DNA分子。

    2.根據權利要求1所述的核酸適體組合物,其特征在于,所述核酸適體組合物還包括如下六個核酸適體中的全部或部分:

    3.根據權利要求2所述的核酸適體組合物,其特征在于,所述核酸適體組合物還包括如下14個核酸適體中的全部或部分:

    4.核酸適體,其特征在于,所述核酸適體為如下二十個核酸適體中的任意一個:

    5.核酸適體衍生物,其特征在于,所述核酸適體衍生物為對權利要求4所述的核酸適體的一端或中間連接熒光素、抗腫瘤藥物、放射性元素、生物酶、生物素和/或納米材料,得到與所述核酸適體具有相同功能的核酸適體衍生物。

    6.核酸適體衍生物組合物,其特征在于,所述核酸適體衍生物組合物包括權利要求5所述核酸適體衍生物中至少2種核酸適體衍生物。

    7.應用,其特征在于,所述應用為權利要求1-3任一項所述的核酸適體組合物、權利要求4所述的核酸適體、權利要求5所述的核酸適體衍生物和/或權利要求6所述的核酸適體衍生物組合物在如下任一所述的應用:

    8.根據權利要求7所述的應用,其特征在于,所述膀胱癌細胞包括但不限于:人膀胱癌細胞YTS-1、人膀胱癌細胞T24、人膀胱癌細胞5637和人膀胱癌細胞KK47;

    9.一種試劑,其有效成分包括權利要求1-3任一項所述的核酸適體組合物、權利要求4所述的核酸適體、權利要求5所述的核酸適體衍生物和/或權利要求6所述的核酸適體衍生物組合物。

    10.如下任一項所述的方法,

    ...

    【技術特征摘要】

    1.核酸適體組合物,其特征在于,所述核酸適體組合物至少包括核酸適體seq12a,所述核酸適體seq12a為核苷酸序列是seq?id?no.21的單鏈dna分子。

    2.根據權利要求1所述的核酸適體組合物,其特征在于,所述核酸適體組合物還包括如下六個核酸適體中的全部或部分:

    3.根據權利要求2所述的核酸適體組合物,其特征在于,所述核酸適體組合物還包括如下14個核酸適體中的全部或部分:

    4.核酸適體,其特征在于,所述核酸適體為如下二十個核酸適體中的任意一個:

    5.核酸適體衍生物,其特征在于,所述核酸適體衍生物為對權利要求4所述的核酸適體的一端或中間連接熒光素、抗腫瘤藥物、放射性元素、生物酶、生物素和/或納米材料,得到與所述核酸適體具有相同功能的核酸適體衍生物。

    6...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:邴濤馮樹維於晶晶徐一鵬張明鑫林恒伊武曉秋王華隆振豪譚蔚泓
    申請(專利權)人:中國科學院杭州醫學研究所
    類型:發明
    國別省市:

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