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【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及核酸檢測,尤其涉及一種snp位點組合及其在北京黑豬個體識別溯源中的應用。
技術介紹
1、北京黑豬是一種地方優質黑豬品種,其不僅具有耐粗飼、早熟多產、肉質香嫩的特點,又有大快長、多肉的特點。保護地方優質黑豬品種,杜絕摻假售假現象,維護高值產品的高端品牌形象,開展此類產品的真實性鑒定研究和溯源研究十分必要。因此,建立一套適于肉制品生產和銷售過程中安全、可信、透明的溯源系統來增強監管效率,保障產品質量,既有利于保障消費者免受欺詐,也有利于保護地方特色肉制品,能夠有效維護地方特色產品的品牌形象,為保護北京地方特色肉制品及其養殖加工企業,提升北京肉類產業整體品牌價值,提供可靠的技術保障。
2、近年來,國內外開展了大量關于肉類產品溯源方面的研究。溯源方法大致分為3類:物理方法(標簽溯源技術等)、化學方法(同位素溯源技術等)和生物技術(dna溯源技術等)。其中,dna溯源技術具有易分型,重復性好、檢測手段簡單快捷、成本低廉等優點,是公認的最具發展潛力和應用價值的快速溯源技術。單核苷酸多態性(snp)是指基因組上的單個核苷酸發生變異而引起多態性的標記方法。利用物種個體基因組的snp差異,構建物種個體的snp特征圖譜,相當于給每個物種個體制作了僅屬于其自身的唯一dna身份證。dna溯源技術不但可以實現肉類食品從養殖到餐桌的全程溯源,且可以實現對個體及品種的準確鑒定。
技術實現思路
1、為了解決現有技術存在的問題,本專利技術提供一種snp位點組合及其在北京黑豬個體識別溯源中的
2、第一方面,本專利技術提供一種snp位點組合,包括snp1-snp20;
3、snp1位于染色體chromosome13第60792655bp,多態性為a/g;
4、snp2位于染色體chromosome8第101773318bp,多態性為a/g;
5、snp3位于染色體chromosome3第29498397bp,多態性為a/g;
6、snp4位于染色體chromosome8第8479022bp,多態性為a/g;
7、snp5位于染色體chromosome14第56216032bp,多態性為a/g;
8、snp6位于染色體chromosome7第3765781bp,多態性為t/c;
9、snp7位于染色體chromosome4第137712833bp,多態性為a/g;
10、snp8位于染色體chromosome4第124157393bp,多態性為c/g;
11、snp9位于染色體chromosome13第156408847bp,多態性為a/g;
12、snp10位于染色體chromosome2第88201093bp,多態性為a/g;
13、snp11位于染色體chromosome5第73144741bp,多態性為t/c;
14、snp12位于染色體chromosome2第25784942bp,多態性為a/g;
15、snp13位于染色體chromosome1第69817848bp,多態性為c/g;
16、snp14位于染色體chromosome2第95533526bp,多態性為a/c;
17、snp15位于染色體chromosome1第813652bp,多態性為t/c;
18、snp16位于染色體chromosome9第62557043bp,多態性為t/c;
19、snp17位于染色體chromosome16第82135347bp,多態性為t/c;
20、snp18位于染色體chromosome16第11109184bp,多態性為t/c;
21、snp19位于染色體chromosome17第2842626bp,多態性為t/g;
22、snp20位于染色體chromosome15第2738859bp,多態性為a/g。
23、第二方面,本專利技術提供一種snp位點組合,包括seq?id?no.1-20所示的核苷酸序列;
24、如seq?id?no.1所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
25、如seq?id?no.2所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
26、如seq?id?no.3所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
27、如seq?id?no.4所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
28、如seq?id?no.5所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
29、如seq?id?no.6所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為t/c;
30、如seq?id?no.7所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
31、如seq?id?no.8所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為c/g;
32、如seq?id?no.9所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
33、如seq?id?no.10所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
34、如seq?id?no.11所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為t/c;
35、如seq?id?no.12所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g;
36、如seq?id?no.13所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為c/g;
37、如seq?id?no.14所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/c;
38、如seq?id?no.15所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為t/c;
39、如seq?id?no.16所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為t/c;
40、如seq?id?no.17所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為t/c;
41、如seq?id?no.18所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為t/c;
42、如seq?id?no.19所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為t/g;
43、如seq?id?no.20所示的核苷酸序列第51位具有多態性,多態性為a/g。
44、第三方面,本專利技術提供一種用于擴增前述snp位點組合的引物組合,包括:
45、用于擴增snp1的引物對primer1,由primer?1f和primer?1r組成,引物序列如seqid?no:21-22所示;
46、用于擴增snp2的引物對primer2,由primer?2f和primer?2r組成,引物序列如seqid?no:23-24所示;
47、用于擴增snp3的引物對primer3,由primer?3本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.一種SNP位點組合,其特征在于,包括SNP1-SNP20;
2.一種SNP位點組合,其特征在于,包括SEQ?ID?NO.1-20所示的核苷酸序列;
3.一種用于擴增權利要求1或2所述SNP位點組合的引物組合,其特征在于,包括:
4.一種分子探針組合,其特征在于,所述分子探針組合用于檢測權利要求1或2所述的SNP位點組合。
5.一種基因芯片,其特征在于,所述基因芯片包括權利要求4所述的分子探針組合。
6.一種試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求1或2所述的SNP位點組合,或權利要求3所述的引物對,或權利要求4所述的分子探針組合,或權利要求5所述的基因芯片。
7.權利要求1或2所述SNP位點組合作為靶點在制備用于北京黑豬品種鑒定、北京黑豬肉制品鑒定或北京黑豬個體溯源的基因芯片中的應用。
8.權利要求1或2所述的SNP位點組合,或權利要求3所述的引物對,或權利要求?4所述的探針組合,或權利要求5所述的基因芯片,或權利要求6所述的試劑盒在如下任一中的應用:
9.根據權利要求8所述的應
10.根據權利要求9所述的應用,其特征在于,所述根據多態性檢測結果判斷實現待測樣本的品種鑒定或個體溯源中的個體溯源包括:
...【技術特征摘要】
1.一種snp位點組合,其特征在于,包括snp1-snp20;
2.一種snp位點組合,其特征在于,包括seq?id?no.1-20所示的核苷酸序列;
3.一種用于擴增權利要求1或2所述snp位點組合的引物組合,其特征在于,包括:
4.一種分子探針組合,其特征在于,所述分子探針組合用于檢測權利要求1或2所述的snp位點組合。
5.一種基因芯片,其特征在于,所述基因芯片包括權利要求4所述的分子探針組合。
6.一種試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求1或2所述的snp位點組合,或權利要求3所述的引物對,或權利要求...
【專利技術屬性】
技術研發人員:李家鵬,韋憶萱,王守偉,趙燕,汪海棠,楊君娜,鄒昊,李享,
申請(專利權)人:中國肉類食品綜合研究中心,
類型:發明
國別省市:
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