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【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】
本公開涉及分子鑒定,特別涉及一種用于鑒定玉米品種的引物組、試劑盒及鑒定方法。
技術(shù)介紹
1、玉米作為全球關(guān)鍵糧食作物,在食品、飼料、生物能源及化工產(chǎn)業(yè)中發(fā)揮重要作用,對糧食安全、農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展及能源轉(zhuǎn)型具有重要影響。玉米品種多樣性和遺傳資源豐富性為育種改良提供了基礎(chǔ)。因此,精確快速的玉米品種鑒定對于遺傳潛力挖掘、種質(zhì)資源保護及打假具有重要意義。
2、目前,玉米品種的dna指紋鑒定主要依賴于ssr(simple?sequence?repeats,簡單重復序列標記)技術(shù),但這面臨著一系列挑戰(zhàn)。例如ssr標記通過一次pcr擴增一個位點,導致檢測通量受限,難以在短時間內(nèi)完成大量標記位點的檢測。此外,dna聚合酶反應過程中易產(chǎn)生的滑脫基因型,給準確區(qū)分真實基因型與滑脫變異帶來了困難,增加了誤判的風險。隨著玉米遺傳研究的深入,ssr標記的分辨率已逐漸難以滿足高度相似的近緣品種的精細鑒別需求。同時,ssr技術(shù)的成本相對較高,工作量大,對于大規(guī)模種質(zhì)資源庫的快速篩查和品種保護工作構(gòu)成了挑戰(zhàn)。因此,需要開發(fā)更為高效、準確、成本效益更高的dna指紋鑒定技術(shù)。。
3、公開內(nèi)容
4、為了解決現(xiàn)有技術(shù)的問題,本公開實施例提供了一種用于鑒定玉米品種的引物組、試劑盒及鑒定方法。所述技術(shù)方案如下:
5、一方面,本專利技術(shù)實施例提供了一種用于鑒定玉米品種的引物組,所述引物組包括:第1引物對至第200引物對,每個所述引物對均包括正向引物和反向引物,所述第1引物對的正向引物、所述第1引物對的反向引物至所述第200引物對
6、另一方面,本專利技術(shù)實施例提供了一種用于鑒定玉米品種的試劑盒,所述試劑盒包括上述引物組。
7、又一方面,本專利技術(shù)實施例提供了一種鑒定玉米品種的方法,所述方法包括:將上述引物組用于鑒定玉米品種。
8、具體地,所述方法包括:
9、利用所述引物組對待測樣本的dna進行多重pcr擴增,得到多重pcr擴增產(chǎn)物;
10、純化所述多重pcr擴增產(chǎn)物,得到純化后的多重pcr擴增產(chǎn)物;
11、利用所述純化后的多重pcr擴增產(chǎn)物構(gòu)建高通量測序文庫,得到所述待測樣本的高通量測序文庫;
12、純化所述待測樣本的高通量測序文庫,得到純化的高通量測序文庫;
13、對所述純化的高通量測序文庫進行測序,得到測序數(shù)據(jù);
14、分析所述測序數(shù)據(jù),獲得dna指紋數(shù)據(jù);
15、將所述dna指紋數(shù)據(jù)與對照樣本進行比較,獲得遺傳相似系數(shù);
16、根據(jù)所述遺傳相似系數(shù),鑒定所述待測樣本的品種。
17、具體地,根據(jù)所述遺傳相似系數(shù),獲得所述待測樣本的品種鑒定結(jié)論:當所述遺傳相似系數(shù)大于或等于96%時,判定所述待測樣本與所述對照樣本為疑同品種。
18、本公開實施例提供的技術(shù)方案帶來的有益效果是:本公開實施例提供了一種用于鑒定玉米品種的引物組、試劑盒及其應用,該引物組用于玉米品種鑒定,在玉米品種鑒定和dna指紋數(shù)據(jù)庫構(gòu)建等方面均具有良好的應用價值,為我國玉米品種的知識產(chǎn)權(quán)保護提供技術(shù)支撐,并促進產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展。該鑒定方法基于高通量測序的mnp標記分型技術(shù),一次pcr可檢測200個標記位點,一次測序可檢測成百上千個待測樣本,使得其成本較低,再通過生物信息分析軟件一次快速分析獲得成百上千個待測樣本間的標記差異信息,從而快速獲得玉米品種鑒定結(jié)論,并且該鑒定方法獲得的每個標記位點分型準確率達99.95%,從而實現(xiàn)了精準高效的玉米品種鑒定。
技術(shù)實現(xiàn)思路
本文檔來自技高網(wǎng)...【技術(shù)保護點】
1.一種用于鑒定玉米品種的引物組,其特征在于,所述引物組包括:第1引物對至第200引物對,每個所述引物對均包括正向引物和反向引物,所述第1引物對的正向引物、所述第1引物對的反向引物至所述第200引物對的正向引物和第200引物對的反向引物依次如序列表中SEQ?ID?NO:1至SEQ?ID?NO:400所示。
2.一種用于鑒定玉米品種的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括如權(quán)利要求1所述的引物組。
3.一種鑒定玉米品種的方法,其特征在于,所述方法包括:將權(quán)利要求1所述的引物組用于鑒定玉米品種。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于,所述方法包括:
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,根據(jù)所述遺傳相似系數(shù),鑒定所述待測樣本的品種包括:當所述遺傳相似系數(shù)大于或等于96%時,判定所述待測樣本與所述對照樣本為疑同品種。
【技術(shù)特征摘要】
1.一種用于鑒定玉米品種的引物組,其特征在于,所述引物組包括:第1引物對至第200引物對,每個所述引物對均包括正向引物和反向引物,所述第1引物對的正向引物、所述第1引物對的反向引物至所述第200引物對的正向引物和第200引物對的反向引物依次如序列表中seq?id?no:1至seq?id?no:400所示。
2.一種用于鑒定玉米品種的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括如權(quán)利...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員:方治偉,彭海,李甜甜,周俊飛,李論,高利芬,陳利紅,
申請(專利權(quán))人:江漢大學,
類型:發(fā)明
國別省市:
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