【技術實現(xiàn)步驟摘要】
本申請涉及豬眼肌面積的，具體涉及一種與豬眼肌面積關聯(lián)的分子標記。
技術介紹
1、眼肌面積(loinmusclearea,lma)是指家畜倒數第一、二胸椎之間背腰最長肌的橫斷面面積，在豬、牛、羊等家畜研究中具有重要意義。豬的眼肌面積是指豬最后肋骨處背最長肌橫截面的面積，用求積儀測出，眼肌面積的計算公式一般為眼肌高(cm)×眼肌寬(cm)×0.7。眼肌面積是衡量豬生長性能和胴體產肉能力的重要指標，它直接關聯(lián)到瘦肉率和背膘厚，這些性狀對于養(yǎng)豬業(yè)來說至關重要。瘦肉型豬在豬肉消費市場中占有很大的份額，胴體瘦肉率在評價胴體品質方面是一個非常重要的指標。研究發(fā)現(xiàn)，瘦肉率與眼肌面積之間呈強相關，通過眼肌面積來估測瘦肉率可以顯著降低成本，所以在瘦肉豬的生產及選育工作中眼肌面積也是非常重要的指標。
2、育種實踐中，眼肌面積的測定對于選擇優(yōu)良遺傳特性的豬只進行繁育，從而提高豬群的整體肉質和性能具有重要作用。通過測定眼肌面積結果，養(yǎng)殖戶可以選擇具有較大眼肌面積的豬只進行繁育，進而達到提高豬的生產效率的目的。因此，眼肌面積不僅是一個重要的肉質指標，也是養(yǎng)豬業(yè)中遺傳改良和選育工作的一個關鍵參數。
技術實現(xiàn)思路
1、本申請專利技術人利用全基因組關聯(lián)分析(gwas)篩選得到與豬眼肌面積關聯(lián)的分子標記，其位于豬10號染色體第3593429nt位置發(fā)生a/g的單核苷酸多態(tài)性位點(ensembl數據庫編號rs81425149)，其中，該位點為aa基因型的個體眼肌面積高于其他個體，由此表明該位點為a型核苷酸能
2、為此，本申請實施例至少公開了以下技術方案：
3、第一方面，實施例公開了與豬眼肌面積關聯(lián)的分子標記，包括豬國際豬參考基因組11.1版本10號染色體第3593429nt位置發(fā)生a/g的單核苷酸多態(tài)性形成的核苷酸序列。
4、第二方面，實施例公開了一種用于檢測第一方面所述的分子標記的引物對，所述引物對的核苷酸序列如seq?id?no:1和seq?id?no:2所示。
5、第三方面，實施例公開了一種試劑盒，包括第二方面所述的引物對及pcr擴增所需試劑。
6、第四方面，實施例公開了一種檢測第一方面所述的分子標記的方法，所述方法包括以下步驟：提取待測豬的基因組dna；將所述待測豬的基因組dna進行pcr擴增，以便獲得pcr擴增產物；對所述pcr擴增產物進行測序，以便獲得測序結果；基于所述測序結果，判讀豬國際豬參考基因組11.1版本10號染色體第3593429nt位點的多態(tài)性。
7、第五方面，實施例公開了與豬眼肌面積關聯(lián)的分子標記，包括如seq?id?no:3和seq?id?no:4所示的核苷酸序列。
8、第六方面，實施例公開了一種選育大眼肌面積豬品系的方法，所述方法包括以下步驟：檢測豬國際豬參考基因組11.1版本豬10號染色體第3593429個核苷酸位點的基因型，選擇第3593429個核苷酸位點的aa型個體作為種豬。
9、第七方面，實施例公開了一種選育大眼肌面積豬品系的方法，包括若檢測到豬基因組dna中含如seq?id?no:3所示的核苷酸序列，將其對應的純合基因型個體作為種豬。
10、第八方面，實施例公開了與大白豬肌內脂肪含量相關聯(lián)的snp位點或引物對在篩選大眼肌面積的豬品系中的應用，所述snp位點為為國際豬基因組11.1版本參考序列豬10號染色體第3593429個核苷酸位點，且具有a/g多態(tài)性。所述引物對的核苷酸序列如seq?idno:1和seq?id?no:2所示。
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1.與豬眼肌面積關聯(lián)的分子標記，包括豬國際豬參考基因組11.1版本10號染色體第3593429nt位置發(fā)生A/G的單核苷酸多態(tài)性形成的核苷酸序列。
2.一種用于檢測如權利要求1所述的分子標記的引物對，所述引物對的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1和SEQ?ID?NO:2所示。
3.一種試劑盒，包括權利要求2所述的引物對及PCR擴增所需試劑。
4.一種檢測如權利要求1所述的分子標記的方法，包括：
5.與豬眼肌面積關聯(lián)的分子標記，包括如SEQ?ID?NO:3和SEQ?ID?NO:4所示的核苷酸序列。
6.一種選育大眼肌面積豬品系的方法，包括：
7.一種選育大眼肌面積豬品系的方法，包括：
8.與大白豬肌內脂肪含量相關聯(lián)的SNP位點或引物對在篩選大眼肌面積的豬品系中的應用，所述SNP位點為為國際豬基因組11.1版本參考序列豬10號染色體第3593429個核苷酸位點，且具有A/G多態(tài)性，所述引物對的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1和SEQ?ID?NO:2所示。
【技術特征摘要】
1.與豬眼肌面積關聯(lián)的分子標記，包括豬國際豬參考基因組11.1版本10號染色體第3593429nt位置發(fā)生a/g的單核苷酸多態(tài)性形成的核苷酸序列。
2.一種用于檢測如權利要求1所述的分子標記的引物對，所述引物對的核苷酸序列如seq?id?no:1和seq?id?no:2所示。
3.一種試劑盒，包括權利要求2所述的引物對及pcr擴增所需試劑。
4.一種檢測如權利要求1所述的分子標記的方法，包括：
5.與豬眼肌面積關聯(lián)的分子標...
【專利技術屬性】
技術研發(fā)人員：曹建華，郭培華，李小龍，胡怡軒，康新婉，
申請(專利權)人：華中農業(yè)大學，
類型：發(fā)明
國別省市：
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