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【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及微生物分析,特別涉及一種微生物鑒定方法、裝置、設備及介質。
技術介紹
1、在臨床或非臨床檢測時,有時需要通過微生物質譜來檢測微生物是否生長的方法。例如進行表型藥敏檢測時,需要在不同濃度抗生素的樣品點中點上相同的微生物后,檢測各樣品點中是否可檢測出對應微生物。此時需要明確的微生物生長判讀方法來完成相關檢測并給出陰陽性結果,其中,陽性表明為生長,陰性表明不生長或不存在。
2、目前,通常采用兩種方法對微生物質譜進行判讀:
3、第一種方法為通過檢測微生物質譜中是否存在一定量的質譜峰,或質譜峰峰高、峰面積、信噪比等屬性來進行判讀,如當質譜峰達到一定數量,且信噪比等屬性達到一定數值時為陽性;否則為陰性;但上述方法存在較多缺陷:對樣品預處理要求高,若樣品預處理處理效果一般,可能使質譜出峰效果不好而導致假陰性;對儀器狀態要求高,若儀器出現衰減,可能使質譜出峰效果不好而導致假陰性;微生物菌種兼容效果差,不同種微生物的蛋白指紋圖譜差異較大,從而導致需要對不同微生物設定不同的閾值作為判斷標準。
4、第二種方法為通過神經網絡模型等人工智能方法將微生物質譜進行訓練,以構成一個二分類器,隨后利用二分類器對微生物質譜進行判讀。但上述方法也存在較多不足:需要大量的陽性或陰性數據進行訓練,并隨著檢測菌種增加,需要收集及訓練的數據將出現線性甚至幾何級增加;當樣本出現污染,尤其是污染的微生物占據主導部分時,檢測準確性大幅減低;愈是復雜的神經網絡等人工智能方法,往往不可解釋性愈強,問題排查困難。
5、由上可
技術實現思路
1、有鑒于此,本專利技術的目的在于提供一種微生物鑒定方法、裝置、設備及介質,能夠基于當前標記數與當前已采樣位置數確定待檢測樣品是否為陽性,從而提高了對微生物進行鑒定的速度,并提升了對微生物進行鑒定所得到的結果的準確性。其具體方案如下:
2、第一方面,本申請提供了一種微生物鑒定方法,應用于預設微生物質譜儀,包括:
3、對目標樣品靶中放置的標準樣品進行采樣與鑒定,以得到與所述標準樣品的標準質譜圖對應的標準鑒定結果;
4、確定所述目標樣品靶中的當前待采樣位置,并利用各預設激光能量對當前待采樣位置上的待檢測樣品進行采樣,以得到相應的當前待鑒定質譜圖,并統計相應的當前已采樣位置數;
5、對當前待鑒定質譜圖進行鑒定以得到相應的當前待對比鑒定結果;
6、將當前待對比鑒定結果與所述標準鑒定結果進行對比,并在當前對比結果滿足預設條件時更新當前標記數;
7、基于當前標記數與當前已采樣位置數確定是否將當前待采樣位置上的待檢測樣品判讀為陽性,然后將所述目標樣品靶中的下一待采樣位置作為新的當前待采樣位置,并跳轉至所述利用各預設激光能量對當前待采樣位置上的待檢測樣品進行采樣的步驟,直到滿足預設循環結束條件。
8、可選的,所述對目標樣品靶中放置的標準樣品進行采樣與鑒定,以得到與所述標準樣品的標準質譜圖對應的標準鑒定結果,包括:
9、對目標樣品靶中放置的標準樣品進行采樣,以得到與所述標準樣品對應的標準質譜圖,并判斷所述標準質譜圖是否符合第一指標;若所述標準質譜圖不符合第一指標,則退出微生物鑒定流程;
10、若所述標準質譜圖符合第一指標,則對所述標準質譜圖進行鑒定,并判斷得到的標準鑒定結果是否滿足預設可信度條件;
11、若所述標準鑒定結果滿足預設可信度條件,則記錄與所述標準樣品對應的標準鑒定結果;若所述標準鑒定結果不滿足預設可信度條件,則退出微生物鑒定流程。
12、可選的,所述確定所述目標樣品靶中的當前待采樣位置,并利用各預設激光能量對當前待采樣位置上的待檢測樣品進行采樣,以得到相應的當前待鑒定質譜圖,并統計相應的當前已采樣位置數之后,還包括:
13、統計當前預設能量序號,并判斷所述當前預設能量序號是否小于激光能量總數量;
14、若所述當前預設能量序號小于激光能量總數量,則觸發利用另一種所述預設激光能量對所述當前待采樣位置中的待檢測樣品進行采樣的操作;
15、若所述當前預設能量序號不小于激光能量總數量,則將所述目標樣品靶中的下一待采樣位置作為新的當前待采樣位置,并跳轉至所述利用各預設激光能量對當前待采樣位置上的待檢測樣品進行采樣的步驟。
16、可選的,所述將當前待對比鑒定結果與所述標準鑒定結果進行對比,并在當前對比結果滿足預設條件時更新當前標記數,包括:
17、將當前待對比鑒定結果與所述標準鑒定結果進行對比,以得到當前比對結果;
18、若所述對比結果表征所述待對比鑒定結果與所述標準鑒定結果一致,則判斷所述待對比鑒定結果是否滿足預設可信度條件;
19、若所述待對比鑒定結果滿足預設可信度條件,則更新所述待檢測樣品對應的當前標記數。
20、可選的,所述將當前待對比鑒定結果與所述標準鑒定結果進行對比,并在當前對比結果滿足預設條件時更新當前標記數,包括:
21、按照所述待對比鑒定結果中菌種鑒定得分從大到小的篩選順序,從與所述待檢測樣品對應的各菌種中確定目標數量個菌種,并判斷所述目標數量個菌種中是否存在與所述標準鑒定結果一致的菌種;
22、若所述目標數量個菌種中存在與所述標準鑒定結果一致的菌種,則判斷所述菌種對應的菌種鑒定得分是否滿足預設可信度條件,若所述菌種對應的菌種鑒定得分滿足預設可信度條件,則觸發所述更新當前標記數的操作。
23、可選的,所述基于當前標記數與當前已采樣位置數確定是否將當前待采樣位置上的待檢測樣品判讀為陽性,包括:
24、判斷所述當前標記數是否等于目標當前標記數,若所述當前標記數等于目標當前標記數,則將所述待檢測樣品判讀為陽性,并退出微生物鑒定流程;
25、若所述當前標記數不等于目標當前標記數,則判斷所述當前已采樣位置數是否大于采樣位置上限值,若所述當前已采樣位置數大于采樣位置上限值,則將所述待檢測樣品判讀為陰性,并退出微生物鑒定流程。
26、可選的,所述基于當前標記數與當前已采樣位置數確定是否將當前待采樣位置上的待檢測樣品判讀為陽性之后,還包括:
27、對所述目標樣品靶進行掃描,以判斷所述目標樣品靶中是否存在未被檢測的待檢測樣品;若所述目標樣品靶中不存在未被檢測的待檢測樣品,則退出微生物鑒定流程;
28、若所述目標樣品靶中存在未被檢測的待檢測樣品,則觸發所述將所述目標樣品靶中的下一待采樣位置作為新的當前待采樣位置的操作。
29、第二方面,本申請提供了一種微生物鑒定裝置,應用于預設微生物質譜儀,包括:
30、鑒定結果獲取模塊,用于對目標樣品靶中放置的標準樣品進行采樣與鑒定,以得到與所述標準樣品的標準質譜圖對應的標準鑒定結果;
31、采樣位置確定模塊,用于確定所述目標樣品靶中本文檔來自技高網...
【技術保護點】
1.一種微生物鑒定方法,其特征在于,應用于預設微生物質譜儀,包括:
2.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述對目標樣品靶中放置的標準樣品進行采樣與鑒定,以得到與所述標準樣品的標準質譜圖對應的標準鑒定結果,包括:
3.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述確定所述目標樣品靶中的當前待采樣位置,并利用各預設激光能量對當前待采樣位置上的待檢測樣品進行采樣,以得到相應的當前待鑒定質譜圖,并統計相應的當前已采樣位置數之后,還包括:
4.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述將當前待對比鑒定結果與所述標準鑒定結果進行對比,并在當前對比結果滿足預設條件時更新當前標記數,包括:
5.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述將當前待對比鑒定結果與所述標準鑒定結果進行對比,并在當前對比結果滿足預設條件時更新當前標記數,包括:
6.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述基于當前標記數與當前已采樣位置數確定是否將當前待采樣位置上的待檢測樣品判讀為陽性,包括:
7.
8.一種微生物鑒定裝置,其特征在于,應用于預設微生物質譜儀,包括:
9.一種電子設備,其特征在于,包括:
10.一種計算機可讀存儲介質,其特征在于,用于保存計算機程序,其中,所述計算機程序被處理器執行時實現如權利要求1至7任一項所述的微生物鑒定方法的步驟。
...【技術特征摘要】
1.一種微生物鑒定方法,其特征在于,應用于預設微生物質譜儀,包括:
2.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述對目標樣品靶中放置的標準樣品進行采樣與鑒定,以得到與所述標準樣品的標準質譜圖對應的標準鑒定結果,包括:
3.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述確定所述目標樣品靶中的當前待采樣位置,并利用各預設激光能量對當前待采樣位置上的待檢測樣品進行采樣,以得到相應的當前待鑒定質譜圖,并統計相應的當前已采樣位置數之后,還包括:
4.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述將當前待對比鑒定結果與所述標準鑒定結果進行對比,并在當前對比結果滿足預設條件時更新當前標記數,包括:
5.根據權利要求1所述的微生物鑒定方法,其特征在于,所述將當...
【專利技術屬性】
技術研發人員:蔡克亞,張青春,王可,苗思佳,劉美麗,趙高嶺,張利紅,常麗娟,
申請(專利權)人:鄭州安圖生物工程股份有限公司,
類型:發明
國別省市:
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