本發(fā)明專(zhuān)利技術(shù)屬于微生物病毒領(lǐng)域,提供了豬源甲型H1N1流感病毒。該病毒含有HA、NA、NP、PB1、PB2、PA、NS、M共8?jìng)€(gè)片段,其核苷酸序列依次分別如說(shuō)明書(shū)的核苷酸序列表中序列1-8所示。本發(fā)明專(zhuān)利技術(shù)通過(guò)健康豬只鼻咽拭標(biāo)本分離培養(yǎng)和DIF、RT-PCR鑒定,以及病毒的8?jìng)€(gè)基因全序列測(cè)序比對(duì),獲得并證實(shí)所分離的病毒為豬甲型H1N1流感病毒毒株,命名為A/swine/zhejiang/26/2009(H1N1),保藏號(hào):CCTCC NO:V201016。本發(fā)明專(zhuān)利技術(shù)的毒株補(bǔ)充了我國(guó)豬只甲型流感病毒的極有價(jià)值的遺傳信息,對(duì)該病原引起感染監(jiān)測(cè)體系的完善有重要作用,還可用于制備甲型H1N1病毒感染的快速診斷試劑。
【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
本專(zhuān)利技術(shù)屬于微生物病毒領(lǐng)域,涉及流感病毒株,具體涉及一種豬甲型Hmi病毒的新毒株及其用途。
技術(shù)介紹
流感病毒分為甲、乙、丙三型,甲型流感病毒最容易發(fā)生變異,流感大流行就是甲型流感病毒出現(xiàn)新亞型或舊亞型重現(xiàn)引起的。甲型流感病毒的表面抗原會(huì)經(jīng)常發(fā)生細(xì)小變異,這種變異被稱(chēng)為“飄變” (drift),形象地說(shuō),“飄變”就是病毒通過(guò)細(xì)小的變化偽裝自己, 從而達(dá)到躲避人體免疫系統(tǒng)識(shí)別的目的。甲型流感病毒“飄變”的結(jié)果是每年引發(fā)流感的毒株都有可能不同,人們每年都需要重新接種流感疫苗進(jìn)行預(yù)防。“轉(zhuǎn)變”(shift)主要是以前流行于人和動(dòng)物的流感病毒基因片段重組的結(jié)果,導(dǎo)致一種新的病毒“亞型”出現(xiàn)。因?yàn)槿梭w內(nèi)幾乎沒(méi)有抵御這種新型病毒的抗體,所以“轉(zhuǎn)變”的結(jié)果往往會(huì)導(dǎo)致流感的全球性大暴發(fā)。2009年4月,始發(fā)于北美的甲型Hmi流感,是北美豬重組株Hmi和歐亞豬流感 Hmi病毒重組而成,它包含了人、禽、豬三個(gè)來(lái)源的基因片段,并且通過(guò)了幾次重組。2009 年6月,WHO宣稱(chēng)此次流感疫情為全球流感大流行。甲型流感病毒是引起人、畜、禽感染的重要人畜共患病毒病原,并可在世界范圍引起人群發(fā)生流感大流行。接種流感疫苗是避免患流感最有效的方法。由于流感病毒經(jīng)常變異,疫苗使用中的主要問(wèn)題是毒種的選擇,制造疫苗的毒株力求接近流行株。目前人群流感病毒的分離主要依靠細(xì)胞培養(yǎng),也有用雞胚培養(yǎng),鑒定型與亞型采用血凝抑制、免疫熒光、 RT-PCR等。2009年的1月,我國(guó)浙江地區(qū)屠宰場(chǎng)宰殺健康豬只鼻咽拭標(biāo)本分離培養(yǎng),鑒定為豬甲型Hmi流感病毒。豬歷來(lái)被認(rèn)為是流感病毒基因發(fā)生重組的重要?jiǎng)游锼拗鳎M管人和豬Hmi流感病毒都起源于禽,但是Hmi流感病毒在豬只中的抗原性相對(duì)穩(wěn)定,人群缺乏對(duì)豬Hmi流感病毒的血清抗體。因此,對(duì)豬只Hmi流感病毒遺傳進(jìn)化信息了解保存,對(duì)掌握流感病毒宿主間重組、溯源,豐富病毒庫(kù),完善對(duì)該病原引起感染監(jiān)測(cè)體系有重大意義。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
本專(zhuān)利技術(shù)的目的是提供一株新的豬源甲型Hmi流感病毒,為豬、人甲型Hmi流感病毒全基因片段變異、重組監(jiān)測(cè)提供生物信息,利用該株豬源甲型Hmi流感病毒制備動(dòng)物免疫血清,為甲型Hmi的HA蛋白變異提供生物信息。本專(zhuān)利技術(shù)另一個(gè)目的是提供上述病毒株的制備方法和疫苗研究。本專(zhuān)利技術(shù)提供了一種豬源甲型Hmi流感病毒,該病毒含有HA、NA、NP、PB1、PB2、PA、 NS、M共8個(gè)片段,8個(gè)片段的核苷酸序列分別如說(shuō)明書(shū)的核苷酸序列表所示。該病毒感染 MDCK細(xì)胞,可致細(xì)胞產(chǎn)生團(tuán)聚變圓、脫落現(xiàn)象。本專(zhuān)利技術(shù)采用屠宰場(chǎng)宰殺的健康豬只鼻咽拭標(biāo)本進(jìn)行病毒的分離培養(yǎng),單克隆熒光抗體鑒定培養(yǎng)物為甲型流感病毒。同時(shí)提取病毒核酸,采用HA、NA、PBU PB2、ΡΑ、Μ、NP、 NS的8個(gè)片段的特異引物進(jìn)行8個(gè)片段全基因RT-PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)凝膠回收后測(cè)序。進(jìn)入GenBank對(duì)8個(gè)片段全基因進(jìn)行搜尋比對(duì),證實(shí)8個(gè)基因均與A/swine/Hong Kong/ NS1179/2007(H1N1)99%同源。HA蛋白327位水解位點(diǎn)處氨基酸序列為“IPSVQSR丨GL”,為非高致病力毒株特征。命名為A/SWine/Zhejiang/^6/2009(Hmi),保藏單位名稱(chēng)中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心,地址中國(guó).武漢市武昌珞珈山.武漢大學(xué),保藏日期2009年6月10 日,保藏號(hào)為 CCTCC NO :V201016,分類(lèi)命名流感病毒A/swine/zhe jiang/^6/2009 (HlNl)。具體來(lái)說(shuō),本專(zhuān)利技術(shù)提供的甲型Hmi流感病毒A/swine/zhejiang/^6/2009(Hmi), 具有8個(gè)片段全基因序列和下述特征1)感染MDCK細(xì)胞引起細(xì)胞團(tuán)聚變圓、破碎;2)熒光標(biāo)記單克隆抗體觀察,顯示被感染細(xì)胞有綠色熒光;3)感染細(xì)胞培養(yǎng)上清能凝集雞紅細(xì)胞4) HA 全基因序列與 A/swine/Hong Kong/NSl 179/2007 (Hmi) 99% 同源5) NA 全基因序列與 A/swine/Hong Kong/NSl 179/2007 (Hmi) 99% 同源6) PBl 全基因序列與 A/swine/Hong Kong/NSl 179/2007 (Hmi) 99% 同源7) PB2 全基因序列與 A/swine/Hong Kong/NSl 179/2007 (Hmi) 99% 同源8) PA 全基因序列與 A/swine/Hong Kong/NSl 179/2007 (Hmi) 99% 同源9)M 全基因序列與 A/swine/Hong Kong/NSl 179/2007 (Hmi) 99% 同源10) NP 全基因序列與 A/swine/Hong Kong/NSl 179/2007 (Hmi) 99% 同源11) NS 全基因序列與 A/swine/Hong Kong/NSl 179/2007 (Hmi) 99% 同源本專(zhuān)利技術(shù)提供了上述病毒的制備方法,包括如下步驟(1)屠宰場(chǎng)宰殺健康豬只鼻咽拭標(biāo)本,經(jīng)抗生素處理置4°C冰箱,4- 后接種于 MDCK細(xì)胞,過(guò)夜;(2)觀察細(xì)胞病變效應(yīng),病變細(xì)胞采用甲型流感病毒單克隆熒光抗體檢測(cè),熒光顯微鏡下觀察鑒定甲型流感病毒;(3)提取病毒 RNA,RNA 反轉(zhuǎn)錄為 c-DNA ;用 ΗΑ、ΝΑ、NP、PB1、PB2、PA、NS、M 共 8 個(gè)片段的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序。所述的抗生素可以是青霉素和鏈霉素。所述的細(xì)胞病變效應(yīng)是指細(xì)胞產(chǎn)生團(tuán)聚變圓、脫落現(xiàn)象。本專(zhuān)利技術(shù)的病毒株可以用于制備豬源甲型流感病毒診斷試劑。也可以用于制備豬源甲型流感病毒疫苗。具體而言,本專(zhuān)利技術(shù)通過(guò)下述方法和步驟進(jìn)行1)樣品采集屠宰場(chǎng)宰殺健康豬只鼻咽拭標(biāo)本,保存在含BSA和雙抗的MEM緩沖液,4h內(nèi)冷鏈運(yùn)送至實(shí)驗(yàn)室。2)病原體分離培養(yǎng)標(biāo)本經(jīng)抗生素處理置4°C冰箱,4h后接種于MDCK細(xì)胞,在5% C0237°C條件下培養(yǎng),第二天觀察細(xì)胞病變效應(yīng)(CPE),病變細(xì)胞采用甲型、乙型流感病毒單克隆熒光抗體檢測(cè),熒光顯微鏡下觀察鑒定甲型、乙型流感病毒。3) RT-PCR鑒定用Trizol法提取病毒RNA ;以血凝素基因片段設(shè)計(jì)引物, MMLV(takara)37°C作用 Ih 將 RNA 反轉(zhuǎn)錄為 c_DNA ;進(jìn)行 PCR,循環(huán)條件為94°C 5min ;94°C 30s,51°C 30s, 72°C 30s, 72°C 5min。擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳觀察產(chǎn)物bp數(shù),鑒定甲型流感病毒亞型。4) 8個(gè)片段測(cè)序引物RT-PCR及序列分析用Trizol法提取病毒RNA ;用Oligo(dT) 和隨機(jī)六核苷酸引物,MMLV(takara) 37°C作用Ih將RNA反轉(zhuǎn)錄為c_DNA ;以血凝素、神經(jīng)氨酸酶、病毒聚合酶(PB1、PB2、PA)、基質(zhì)蛋白、核蛋白、非結(jié)構(gòu)蛋白8個(gè)基因片段設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行 PCR,循環(huán)條件為94°C 5min ;94°C 30s,51°C 30s, 72°C 30s, 72°C 5min。擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳切割回收提純后在DNA序列自動(dòng)分析儀上測(cè)序。5)8個(gè)片段基因進(jìn)化分析用MEGA4軟件對(duì)測(cè)序的8個(gè)片段基因進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生分析構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果顯示1)MDCK細(xì)胞為狗腎二倍體上皮細(xì)胞,細(xì)胞呈上皮樣形態(tài);細(xì)胞感染流感本文檔來(lái)自技高網(wǎng)...
【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】
1.一種豬源甲型H1N1流感病毒,其特征在于,該病毒含有HA、NA、NP、PB1、PB2、PA、NS、M共8?jìng)€(gè)片段,8?jìng)€(gè)片段的核苷酸序列依次如SEQ ID NO 1-8所示,該該病毒的保藏號(hào)為CCTCC NO:V201016。
【技術(shù)特征摘要】
【專(zhuān)利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員:居麗雯,蔣露芳,姜慶五,
申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人:復(fù)旦大學(xué),
類(lèi)型:發(fā)明
國(guó)別省市:31[]
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