肺癌生物標記及其用途制造技術

本發明專利技術包括用于檢測和診斷肺癌的生物標記、方法、裝置、試劑、系統和試劑盒。在一方面，本申請提供了生物標記，其可以單獨使用或以各種組合使用來診斷肺癌或允許區分診斷肺結節為良性或惡性的。在另一方面，本申請提供了診斷個體的肺癌的方法，其中所述方法包括在來自個體的生物學樣品中檢測至少一個生物標記值，所述至少一個生物標記值對應于選自表18、表20或表21提供的生物標記的組的至少一個生物標記，其中基于所述至少一個生物標記值，所述個體分類為患有肺癌，或者確定所述個體患有肺癌的似然性。

【技術實現步驟摘要】
【國外來華專利技術】肺癌生物標記及其用途 相關串請本申請要求于2010年7月9日提交的美國臨時申請系列號61/363，122以及于 2011年2月21日提交的美國臨時申請系列號61/444,947的權益，這兩個臨時申請的題目均為“肺癌生物標記及其用途”。為了所有目的，這些申請每個整體援引加入本文。專利
本申請一般涉及個體中生物標記的檢測及癌癥的診斷，更具體地涉及用于診斷個體的癌癥，更特別是肺癌的一種或多種生物標記、方法、裝置、試劑、系統和試劑盒。
技術介紹
下面的描述提供了本申請相關信息的概述，并非承認任何本文提供的信息或者引用的出版物是本申請的現有技術。肺癌是癌癥相關死亡率的最常見的原因。這對于男性和女性都是如此。2005年在美國，肺癌死亡比乳腺癌、前列腺癌和結腸癌死亡的組合還多。在那一年，107，416名男性和89，271名女性診斷患有肺癌，并且90，139名男性和69，078女性死于肺癌。在美國男性中，肺癌是白人男性、黑人男性、亞裔/太平洋島男性、美國印第安男性/阿拉斯加土著男性以及西班牙裔男性中第二常見的癌癥。在美國女性中，肺癌是白人女性、黑人女性和美國印第安女性/阿拉斯加土著女性中第二常見的癌癥，并且是亞裔/太平洋島女性和西班牙裔女性中第三常見的癌癥。對于不戒煙的人，肺癌死亡率為15%，甚至對于50-59歲的戒煙的人仍為5%以上。僅美國在肺癌上每年保健費用就為950億美元。91%由吸煙所致的肺癌是非小細胞肺癌(NSCLC)，其占所有肺癌的約87%。所有肺癌中剩余的13%是小細胞肺癌，雖然混合細胞肺癌確有發生。因為小細胞肺癌罕見且迅速致死，所以早期檢測機會不大。NSCLC有三種主要類型鱗狀細胞癌、大細胞癌和腺癌。腺癌是最常見形式的肺癌 (30%-40%，且據報道高達50%)，并且是在吸煙者和非吸煙者中最常發現的肺癌。鱗狀細胞癌占所有肺癌的25-30%，并且通常在近端支氣管中發現。早期NSCLC傾向于局部化，如果早期檢測到，其通?？梢允中g治療，并且結果有利且存活率改善。其他治療選擇包括放療、藥物療法和這些方法的組合。NSCLC根據腫瘤大小及其在包括淋巴結在內的其他組織中的存在來分期。在隱藏期，癌細胞在痰樣品或灌洗樣品中發現，在肺中檢測不到腫瘤。在O期，僅肺最深的內襯 (lining)表現出癌細胞，腫瘤尚未生長通過內襯。在IA期，癌癥被認為是侵襲性的，并且已生長深入肺組織，但是腫瘤橫向(across)小于3cm。在這個時期，在支氣管或淋巴結中未發現腫瘤。在IB期，腫瘤橫向大于3cm或者已生長入支氣管或胸膜，但是尚未生長入淋巴結。 在IIA期，腫瘤橫向大于3cm，并且已生長入淋巴結。在IIB期，腫瘤在淋巴結中發現并且橫向大于3cm，或者已生長入支氣管或胸膜；或者癌癥不在淋巴結中但是在胸壁、膈、胸膜、 支氣管或圍繞心臟的組織中發現。在IIIA期，癌細胞在肺和支氣管附近的淋巴結中以及肺之間的淋巴結中，但是在腫瘤所位于的胸的一側上。在IIIB期，癌細胞位于胸的腫瘤的對側及在頸中。肺附近的其他器官也可以具有癌細胞，并且在一個肺葉中可以發現多個腫瘤。 在IV期，腫瘤在相同肺或兩個肺的多于一個的肺葉中發現，并且癌細胞在身體其他部分發現。目前肺癌診斷方法包括測試痰的癌細胞、胸部X-射線、呼吸道的纖維光學評價和低劑量螺旋計算機斷層掃描(CT)。痰細胞學的靈敏性非常低。胸部X-射線也較不靈敏， 要求病灶的大小大于Icrn以可見。支氣管鏡檢查要求腫瘤在支氣管鏡可及的呼吸道內可見。最廣泛認可的診斷方法是CT，但是常與X-射線一起，CT的應用涉及電離輻射，其本身可以導致癌癥。CT還有明顯的限制掃描需要高技術水平以解釋，并且許多觀測的異常事實上不是肺癌，在跟蹤CT發現中產生很大保健花費。最常見伴隨發現是良性肺結節(lung nodule)。肺結節是較圓的病灶或異常組織區域，其位于肺中且大小可變。肺結節可以是良性或癌性的，但是大多數是良性的。如果小結小于4_，則發病率僅為1.5%，如果小結為 4-8mm,則發病率為約6%，如果超過20mm，則發病率為約20%。對于小和中等大小的小結，建議患者在3個月至I年內重復掃描。對于許多大的小結，患者接受生物活檢(其是侵入性的并且可能導致并發癥)，即使大部分小結是良性的。因此，亟需可以替代或補充CT的診斷方法以減少進行的手術數量及降低手術并發癥的風險。另外，甚至當不存在或未知肺結節時，需要在早期檢測肺癌的方法以改善患者的結局。僅16%的肺癌病例診斷為局部早期癌癥，其中5年存活率為46%，相比之下，在晚期診斷的為84%，其中5年存活率僅為13%。這證實依賴于癥狀診斷是無用的，因為它們中的許多是其他肺疾病常見的。這些癥狀包括久咳、血痰、胸痛和復發性支氣管炎或肺炎。當存在癌癥早期診斷方法時，益處通常是醫療行業所接受的。廣泛使用篩查方案的癌癥具有最高的5年存活率，如乳腺癌(88%)和結腸癌(65%)，相比之下肺癌為16%。但是，如果癌癥在I期通過篩查診斷，則88%的肺癌患者存活10年或更長。這證實明顯亟需可以可靠地檢測早期NSCLC的診斷方法。從健康狀態發展至疾病伴隨著受影響的組織中蛋白表達的變化。健康和疾病組織中人蛋白質組的比較查詢(interrogation)可以提供對疾病生物學的深入了解,并且導致發現用于診斷的生物標記、治療性干預的新靶標以及鑒定最可能受益于靶向治療的患者。 特定疾病狀態的生物標記的選擇首先涉及鑒定標記，該標記對特定醫療應用在疾病群體中具有與對照群體相比可測量且統計學顯著的差異。生物標記可以包括分泌或脫落(shed) 的分子，其與疾病發展或進程平行，并且容易從肺組織或遠端組織對病灶響應而擴散入血流。鑒定的生物標記或生物標記的集合(set)通常臨床上進行驗證,或者證實為對其所選的原始預期用途是可靠的指示物。生物標記可以包括小分子、肽、蛋白和核酸。影響生物標記鑒定的一些關鍵問題包括可用數據的過擬合(over-fitting)及數據偏差。已使用各種方法來試圖鑒定生物標記及診斷疾病。對于基于蛋白的標記，這些方法包括二維電泳、質譜和免疫測定方法。對于核酸標記，這些方法包括mRNA表達譜、微RNA 譜、FISH、基因表達系列分析(SAGE)和大規?；虮磉_陣列。二維電泳的應用由于如下問題而受限低檢測靈敏度；與蛋白溶解性、電荷及疏水性相關的問題；凝膠再現性；以及單個斑點代表多種蛋白的可能性。對于質譜，取決于所用形式，限制圍繞樣品加工和分離、對低豐度蛋白的靈敏性、信噪比考慮及不能立即鑒定檢測的蛋白而出現。免疫測定方法發現生物標記的限制集中在基于抗體的多重測定不能測量大量分析物?？梢院唵蔚赜∷⒏哔|量抗體的陣列，并且無需夾心而測量與這些抗體結合的分析物。(這會是使用全基因組核酸序列經雜交測量有機體或細胞中的全部DNA或RNA序列的方式上的等同物。因為雜交可以是同一性的嚴緊測試，所以雜交實驗可行。甚至非常好的抗體在選擇它們的結合配偶體中也并非足夠嚴緊來在血液或甚至是細胞提取物環境中工作，因為那些基質中的蛋白總體(ensemble)具有極其不同的豐度。)因此，必須使用不同的基于免疫測定的方法以發現生物標記-需要使用多重ELISA測定(即夾心)以獲得足夠嚴緊性來同時測量許多分析物從而決定哪些分析物的確是生物本文檔來自技高網...

【技術保護點】

【技術特征摘要】
【國外來華專利技術】...

【專利技術屬性】
技術研發人員：S·威爾科克斯，D·艾爾斯，N·亞尼奇，L·戈爾德，M·里爾米恩，T·賈維斯，
申請(專利權)人：私募蛋白質體公司，
類型：
國別省市：