甘蔗屬植物的黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物及其利用制造技術(shù)

本發(fā)明專利技術(shù)提供在甘蔗屬植物的量的性狀中與黑穗病抵抗性相關(guān)的標(biāo)志物。甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物，其包含選自甘蔗的染色體中的由序列號1所示的堿基序列和序列號14所示的堿基序列所夾的區(qū)域及其他區(qū)域中的連續(xù)的核酸區(qū)域。

【技術(shù)實(shí)現(xiàn)步驟摘要】
【國外來華專利技術(shù)】甘蔗屬植物的黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物及其利用
本專利技術(shù)涉及能夠篩選對黑穗病顯示抵抗性的甘蔗屬植物系統(tǒng)的黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物及其利用方法。
技術(shù)介紹
甘蔗除了作為砂糖的原料、酒類原料等為了食用而栽培之外，還在包含作為生物燃料原料的利用的各種產(chǎn)業(yè)領(lǐng)域被利用。在這樣的狀況下，有開發(fā)具有所需的特性(例如，糖含量、生長力的增強(qiáng)、新芽形成能力、耐病性和蟲害抵抗性、耐寒性、葉長的增大、葉面積的增大、莖長的增大等)的甘蔗屬植物的新品種的需要。一般地，作為植物品種.系統(tǒng)的識別，有以下3種方法:比較特性數(shù)據(jù)的“特性比較”、在同一條件下栽培而比較的“比較栽培”、分析DNA的“DNA分析”。利用特性比較和比較栽培的系統(tǒng)識別存在由于栽培條件的不同而精度降低、需要巨大的生產(chǎn)成本的長時(shí)間的農(nóng)場調(diào)查等大量問題。特別是，甘蔗與稻、玉米等其他禾本科作物相比，植物體極大，利用農(nóng)場調(diào)查的系統(tǒng)識別的實(shí)施困難。另外，為了識別針對特定病害的抵抗性品種，將甘蔗長時(shí)間栽培后，進(jìn)行接種病原微生物的試驗(yàn)，然后，通過觀察病斑等來收集抵抗性數(shù)據(jù)。但是，為了進(jìn)行該試驗(yàn)，必須確實(shí)地防止病原微生物對外部環(huán)境的傳播，需要大規(guī)模專用溫室和/或?qū)Ｓ棉r(nóng)場、與外部的隔離設(shè)施等設(shè)備。進(jìn)而，為了制作甘蔗的新品種，首先，通過雜交而制作數(shù)萬種的雜交種，從中進(jìn)行由種子發(fā)芽而生長的篩選，進(jìn)而階段性地篩選出優(yōu)良的系統(tǒng)，最終獲得具有所需的特性的2~3種新品種。這樣，為了制作甘蔗的新品種，需要栽培.評價(jià)非常多的系統(tǒng)，準(zhǔn)備如上所述的溫室、農(nóng)場需要大量的工夫。因此，要求開發(fā)使用存在于基因組中的標(biāo)志物來識別顯示病害抵抗性的甘蔗系統(tǒng)的方法。特別是，在制作甘蔗中的新品種時(shí)，如果能夠?qū)τ诟鞣N特性使用優(yōu)異的標(biāo)志物，則可以回避如上所述的甘蔗所特有的諸問題，成為非常有效的工具。然而，甘蔗屬植物由于高倍體性而染色體數(shù)較多(約100~130)，因而標(biāo)志物技術(shù)開發(fā)緩慢。對于甘蔗，雖然在USDA有關(guān)于使用SSR標(biāo)志物的基因型確定的報(bào)告(非專利文獻(xiàn)I)，但由于標(biāo)志物數(shù)和來自各標(biāo)志物的多態(tài)性數(shù)少而精度低、適用范圍限于美國、澳大利亞品種，因此不能在日本國內(nèi)和臺灣、印度等的主要品種和有用的遺傳資源的系統(tǒng)識別中利用。另外，非專利文獻(xiàn)2啟示了通過增加標(biāo)志物數(shù)、比較、驗(yàn)證各個(gè)標(biāo)志物的特性關(guān)系來制作甘蔗中的基因圖譜的可能性。然而，非專利文獻(xiàn)2中沒有公開足夠數(shù)量的標(biāo)志物，也沒有發(fā)現(xiàn)與目的特性連鎖的標(biāo)志物。另一方面，作為與病害抵抗性相關(guān)的標(biāo)志物，如專利文獻(xiàn)I所示，已知甜菜中的黑根病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物。另外，如專利文獻(xiàn)2所示，在玉米中開發(fā)了利用與目的性狀連鎖的標(biāo)志物來篩選品種的技術(shù)。另一方面，甘蔗的黑穗病，病原微生物的感染力強(qiáng)，一旦發(fā)病則感染在整個(gè)農(nóng)場擴(kuò)大?；剂撕谒氩〉母收岵坏荒茏鳛橹铺怯迷侠茫疫€會(huì)枯死。因此，黑穗病的發(fā)生會(huì)引起次年以后的大幅減收。黑穗病的受害在巴西、美國、澳大利亞、中國、印度尼西亞等28個(gè)以上的國家有報(bào)告。黑穗病的防除方法有種植時(shí)的殺菌處理，但效果僅限于初期生長時(shí)。因此，要求育成賦予了黑穗病的抵抗性的甘蔗品種。現(xiàn)有技術(shù)文獻(xiàn)非專利文獻(xiàn)非專利文獻(xiàn)1:Maydica48 (2003) 319-329 “Molecular genotyping of sugarcaneclones with microsatellite DNA markers，，非專利文獻(xiàn)2:Nathalie Piperidis et al.,MolecularBreeding, 2008, Vol21, 233-247專利文獻(xiàn)專利文獻(xiàn)1:W02007/125958專利文獻(xiàn)2:日本特開2010-516236號公報(bào)
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
專利技術(shù)要解決的課題因而，本專利技術(shù)的目的是提供在甘蔗的量的性狀中與黑穗病抵抗性相關(guān)的標(biāo)志物。用于解決課題的方法 本【專利技術(shù)者】們?yōu)榱私鉀Q上述課題而反復(fù)進(jìn)行了深入研究，結(jié)果，準(zhǔn)備甘蔗屬植物中的多個(gè)標(biāo)志物，通過雜交后代系統(tǒng)中的量的性狀與標(biāo)志物的連鎖分析，發(fā)現(xiàn)了與黑穗病抵抗性這樣的量的性狀連鎖的標(biāo)志物，從而完成了本專利技術(shù)。本專利技術(shù)包含以下(I)~(6)。(I)甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物，其包含選自甘蔗的染色體中的由序列號I所不的喊基序列和序列號14所不的喊基序列所夾的區(qū)域、由序列號15所不的喊基序列和序列號22所不的喊基序列所夾的區(qū)域、由序列號23所不的喊基序列和序列號32所不的喊基序列所夾的區(qū)域、由序列號33所示的堿基序列和序列號51所示的堿基序列所夾的區(qū)域、由序列號52所不的喊基序列和序列號62所不的喊基序列所夾的區(qū)域、由序列號63所不的喊基序列和序列號72所不的喊基序列所夾的區(qū)域、或由序列號73所不的喊基序列和序列號85所示的堿基序列所夾的區(qū)域中的連續(xù)的核酸區(qū)域。(2)根據(jù)(I)所述的甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物，其特征在于，所述核酸區(qū)域包含選自由序列號I~85組成的群組中的任一堿基序列或該堿基序列的一部分。(3)根據(jù)(I)所述的甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物，其特征在于，所述核酸區(qū)域位于甘蔗的染色體中的由序列號5所示的堿基序列和序列號9所示的堿基序列所夾入的區(qū)域、由序列號18所不的喊基序列和序列號22所不的喊基序列所夾入的區(qū)域、由序列號25所不的喊基序列和序列號32所不的喊基序列所夾入的區(qū)域、由序列號33所不的喊基序列和序列號42所不的喊基序列所夾入的區(qū)域、由序列號57所不的喊基序列和序列號59所不的喊基序列所夾入的區(qū)域、由序列號64所不的喊基序列和序列號66所不的喊基序列所夾入的區(qū)域、或由序列號72所示的堿基序列和序列號80所示的堿基序列所夾入的區(qū)域中。(4)黑穗病抵抗性提高了的甘蔗系統(tǒng)的制造方法，其包括以下工序，提取工序:提取至少一方親本是甘蔗屬植物的后代植物的染色體和/或該親本的染色體，和測定工序:測定上述(I)~(3)的任一項(xiàng)所述的甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物在上述所得的染色體中的存在或不存在。(5)根據(jù)(4)所述的甘蔗系統(tǒng)的制造方法，其特征在于，在所述測定工序中，使用具備與所述甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物對應(yīng)的探針的DNA芯片。(6)根據(jù)(4)所述的甘蔗系統(tǒng)的制造方法，其特征在于，所述后代植物是種子或幼苗，由該種子或幼苗提取染色體。本說明書包含作為本申請的優(yōu)先權(quán)基礎(chǔ)的日本專利申請2011-101050號和日本專利申請2012-94995號的說明書和/或附圖所記載的內(nèi)容。專利技術(shù)的效果根據(jù)本專利技術(shù)，可以提供在甘蔗中的量的性狀中與黑穗病抵抗性連鎖的新的甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物。通過利用本專利技術(shù)的甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物，可以檢定甘蔗的雜交系統(tǒng)中的黑穗病抵抗性。由此，可以非常低成本地識別具有黑穗病抵抗性提高了的特性的甘蔗系統(tǒng)?！靖綀D說明】圖1是顯示在獲得甘蔗染色體的標(biāo)志物時(shí)使用的DNA微陣列的制造流程的示意圖。圖2是顯示使用DNA微陣列的信號檢出的工序的示意圖。圖3是顯示對于實(shí)施例中使用的甘蔗品種?系統(tǒng)群于2010年6月23日調(diào)查的黑穗病抵抗性數(shù)據(jù)的特性圖。圖4是顯示對于實(shí)施例中使用的甘蔗品種?系統(tǒng)群于2010年7月21日調(diào)查的黑穗病抵抗性數(shù)據(jù)的特性圖。圖5是顯示對于實(shí)施例中使用的甘蔗品種?系統(tǒng)群于2010年8月18日調(diào)查的黑穗病抵抗性數(shù)據(jù)的特性圖。圖6是顯示對于實(shí)施例中使用的甘蔗品種.系統(tǒng)群于2010年9月2日調(diào)查的黑穗病抵抗本文檔來自技高網(wǎng)...

【技術(shù)保護(hù)點(diǎn)】

【技術(shù)特征摘要】
【國外來華專利技術(shù)】2011.04.28 JP 101050/2011;2012.04.18 JP 094995/2011.甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物，其包含選自甘蔗的染色體中的由序列號I所示的堿基序列和序列號14所不的喊基序列所夾的區(qū)域、由序列號15所不的喊基序列和序列號22所不的喊基序列所夾的區(qū)域、由序列號23所不的喊基序列和序列號32所不的喊基序列所夾的區(qū)域、由序列號33所示的堿基序列和序列號51所示的堿基序列所夾的區(qū)域、由序列號52所不的喊基序列和序列號62所不的喊基序列所夾的區(qū)域、由序列號63所不的喊基序列和序列號72所不的喊基序列所夾的區(qū)域、或由序列號73所不的喊基序列和序列號85所不的堿基序列所夾的區(qū)域中的連續(xù)的核酸區(qū)域。2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物，其特征在于，所述核酸區(qū)域包含選自由序列號I~85組成的群組中的任一堿基序列或該堿基序列的一部分。3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的甘蔗黑穗病抵抗性相關(guān)標(biāo)志物，其特征在于，所述核酸區(qū)域位于甘蔗的染色體中的...

【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：榎宏征，木村達(dá)郎，西村哲，村上亞矢，寺內(nèi)方克，境垣內(nèi)岳雄，服部太一朗，石川葉子，寺島義文，
申請(專利權(quán))人：豐田自動(dòng)車株式會(huì)社，
類型：
國別省市：