本發(fā)明專利技術(shù)公開了GATA4基因SNP位點的用途。本發(fā)明專利技術(shù)公開的用途是rs867858和／或rs904018在制備先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。本發(fā)明專利技術(shù)首次發(fā)現(xiàn)位于GATA4基因SNP位點rs867858和rs904018與先心病室間隔缺損相關(guān)。因此可通過GATA4基因SNP位點rs867858和rs904018的基因型來預(yù)測患者的先心病室間隔缺損易感風(fēng)險性。本發(fā)明專利技術(shù)的檢測試劑盒具有良好靈敏性、穩(wěn)定性和特異性。本發(fā)明專利技術(shù)的試劑盒對未出生胎兒進(jìn)行先心病室間隔缺損易感性的篩查，能有效起到風(fēng)險預(yù)警、早期診斷、降低人口出生缺陷率的作用。
【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】
【專利摘要】本專利技術(shù)公開了GATA4基因SNP位點的用途。本專利技術(shù)公開的用途是rs867858和／或rs904018在制備先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。本專利技術(shù)首次發(fā)現(xiàn)位于GATA4基因SNP位點rs867858和rs904018與先心病室間隔缺損相關(guān)。因此可通過GATA4基因SNP位點rs867858和rs904018的基因型來預(yù)測患者的先心病室間隔缺損易感風(fēng)險性。本專利技術(shù)的檢測試劑盒具有良好靈敏性、穩(wěn)定性和特異性。本專利技術(shù)的試劑盒對未出生胎兒進(jìn)行先心病室間隔缺損易感性的篩查，能有效起到風(fēng)險預(yù)警、早期診斷、降低人口出生缺陷率的作用。【專利說明】GATA4基因SNP位點的用途
本專利技術(shù)屬于生物醫(yī)藥
，具體涉及GATA4基因SNP位點的用途及相關(guān)試劑盒。
技術(shù)介紹
先天性心臟病(CHDs)是指在胎兒期心臟和(或)胸內(nèi)大血管就存在嚴(yán)重的結(jié)構(gòu)異常，從而導(dǎo)致一系列血流動力學(xué)障礙或功能性障礙的一種出生缺陷性疾病，它是造成發(fā)展中國家兒童死亡最常見的原因之一，其國內(nèi)患病率為0.13% -1.38%,國外統(tǒng)計為0.4%-5%。先天性心臟病有很多類型，包括室間隔缺損(Ventricular septaldefect, VSD)、房間隔缺損(Atrial septal defect, ASD)、動脈導(dǎo)管未閉(Patent ductusafteriosus, PDA)、肺動脈瓣狹窄(Pulmonary stenosis, PS)、主動脈縮窄(Coarctationof aortic, CoA)、大動脈轉(zhuǎn)位(Transposition of the great arteries, TGA)、法洛四聯(lián)癥(Tetralogy of Fallot, T0F)、右室雙出口(Double—outlet right ventricle, D0RV)等。其中室間隔缺損居先天性心臟缺損首位。室間隔缺損最早是Dalrymple在1847年報道的，它指心室的間隔部分因組織缺損形成異常開口而引起心室間異常血流交通，從而造成血液自左向右分流，導(dǎo)致血流動力學(xué)異常的一種先天性心臟缺損。正常情況下，右房收集來自全身各部位的氧含量較低的靜脈血(缺氧血)，流經(jīng)右室然后泵入肺中進(jìn)行氣體交換。經(jīng)過肺換氣后，來自肺臟中的氧含量較高的動脈血(充氧血) 流入左房，再流經(jīng)左室，然后通過大動脈被泵入到身體的其他區(qū)域，以供給身體各部位的正常活動。當(dāng)出現(xiàn)室間隔缺損時，由于左室的壓力高，左室內(nèi)的充氧血就會通過間隔上的異常開口而進(jìn)入右室，這就導(dǎo)致額外的血液通過右室泵入肺中，從而造成肺充血。單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotide polymorphism, SNP)是指存在于某一(些)群體、正常個體的基因組DNA中單堿基的序列差異，并且在人群中的分布頻率至少要在1%以上(Brookes AJ.Gene，1999，234 (2):177—186)，人類遺傳基因的多態(tài)性在遺傳信息上的本質(zhì)表現(xiàn)，90%以上是由SNP所引起的。因為其多態(tài)信息量大，目前已成為繼限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)標(biāo)志和微衛(wèi)星即短串聯(lián)重復(fù)(STR)標(biāo)志后的第三代遺傳標(biāo)志。從基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)到臨床醫(yī)學(xué)的各個領(lǐng)域，SNP都存在巨大的應(yīng)用價值。SNP的研究為基因診斷，尤其是疾病的早期診斷提供更多依據(jù)有重要意義。SNP由于其分布廣、密度高而被期望在諸如癌癥、糖尿病、高血壓、憂郁癥和哮喘等復(fù)雜疾病的研究中起重要作用，這些復(fù)雜疾病是多個遺傳變異位點與環(huán)境因子共同作用的結(jié)果，由于發(fā)病原因復(fù)雜，涉及的基因數(shù)量多，已成為國際上疾病基因組學(xué)研究的重點。目前已有實驗將SNP應(yīng)用于腫瘤預(yù)后及易感性的判斷，例如肺癌致癌物的易感性存在個體差異，即肺癌的基因易感性，研究較多的是代謝酶基因多態(tài)性，如人細(xì)胞色素P450-CYP450和髓過氧化酶MPO等。法國研究者證實，MPO基因啟動子(463G / A)多態(tài)性導(dǎo)致該基因較低的表達(dá)，可以降低肺癌患病的危險性(ChewierI，Stucker !,Houllier AM,et al.pharmacogenetics,2003,13(2):729-739)。日本學(xué)者發(fā)現(xiàn)了 HER-2基因編碼區(qū)的一個SNP與胃癌的發(fā)展及惡性程度有關(guān)(Kuraoka K，Matsumura S, Hamai Y,et al.1ht J Cancer,2003,107(4):593-596)。
技術(shù)實現(xiàn)思路
本專利技術(shù)所要解決的技術(shù)問題是為胎兒先心病室間隔缺損易感性的早期診斷提供一種檢測方法及相關(guān)試劑盒。下述應(yīng)用都是本專利技術(shù)所要保護(hù)的內(nèi)容:UGATA4基因SNP位點rs867858和/或rs904018在制備先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。其中，GATA4基因SNP位點rs867858的基因型為T / G時，先天性心臟病易感性增加；GATA4基因SNP位點rs904018的基因型為G / G時，先天性心臟病易感性降低。2、GATA4基因SNP位點單倍型在制備先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。其中，單倍型為rs8678586 / rs904018G時，先天性心臟病易感性降低。3、GATA4基因SNP位點rs867858在制備女性先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。其中，GATA4基因SNP位點rs867858的基因型為T / G時，女性先天性心臟病易感性增加。4、GATA4基因SNP位點rs904018在制備男性先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。其中，GATA4基因SNP位點rs904018的基因型為G / G時，男性先天性心臟病易感性降低。5、檢測GATA4基因SNP位點rs867858和/或rs904018的物質(zhì)在制備先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。其中，GATA4基因SNP位點rs867858的基因型為T / G時，先天性心臟病易感性增加；GATA4基因SNP位點rs904018的基因型為G / G時，先天性心臟病易感性降低。6、檢測GATA4基因SNP位點rs867858的物質(zhì)在制備女性先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。其中，GATA4基因SNP位點rs867858的基因型為T / G時，女性先天性心臟病易感性增加。7、檢測GATA4基因SNP位點rs904018的物質(zhì)在制備男性先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。其中，GATA4基因SNP位點rs904018的基因型為G / G時，男性先天性心臟病易感性降低。上述任一所述應(yīng)用中，所述先天性心臟病的類型為室間隔缺損。本領(lǐng)域技術(shù)人員能通過檢測SNP位點的任何方法或技術(shù)來檢測GATA4基因SNP位點。例如，Taqman法、質(zhì)譜法、DNA微陣列法、測序法、微測序、雜交、限制性片段分析、寡核苷酸連接檢測、等位基因特異性PCR-HRM或聯(lián)合應(yīng)用上述方法。本專利技術(shù)還具體提供了一種先天性心臟病易感性的診斷試劑盒。該診斷試劑盒，包括檢測GATA4基因SNP位點rs867858和/或rs904018的物質(zhì)。其中，所述檢測GATA4基因SNP位點rs867858和/或rs904018的物質(zhì)包括基因組DNA抽提試劑、PCR擴增引物對、PCR反應(yīng)體系試劑、和HRM熒光染料試劑。所述PC`R 擴增引物對如 SEQ ID N0.1、本文檔來自技高網(wǎng)...
【技術(shù)保護(hù)點】
GATA4基因SNP位點rs867858和／或rs904018在制備先天性心臟病易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。
【技術(shù)特征摘要】
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：謝小冬，蘇剛，李培強，吳驊，李炯，李靜，
申請(專利權(quán))人：謝小冬，
類型：發(fā)明
國別省市：甘肅;62
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